MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Helicobacter pylori HPAG1 chromosome

Total Repeats: 3063

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008086	CAT	2	6	19	24	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_008086	T	6	6	24	29	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008086	AC	3	6	60	65	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_008086	CA	3	6	76	81	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_008086	ATT	2	6	202	207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008086	T	6	6	210	215	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008086	CCT	2	6	268	273	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_008086	T	7	7	350	356	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_008086	GTT	2	6	367	372	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008086	TTAAA	2	10	440	449	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008086	A	7	7	504	510	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_008086	ATT	2	6	1275	1280	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_008086	TTA	2	6	1301	1306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_008086	AAAC	2	8	1308	1315	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_008086	T	6	6	1462	1467	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008086	AAT	2	6	1480	1485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008086	T	6	6	1499	1504	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008086	GTTTT	2	10	3945	3954	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_008086	GGT	2	6	5604	5609	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008086	TAT	2	6	5652	5657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008086	TGG	2	6	5705	5710	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_008086	ATGC	2	8	5809	5816	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_008086	TGG	2	6	5825	5830	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008086	GTG	2	6	5941	5946	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_008086	ACC	2	6	5973	5978	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_008086	GGT	2	6	5986	5991	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_008086	T	8	8	6125	6132	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_008086	TTA	2	6	6339	6344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_008086	T	6	6	6356	6361	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_008086	A	6	6	6366	6371	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_008086	A	6	6	6382	6387	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_008086	TGT	2	6	6421	6426	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_008086	TTTTA	2	10	6454	6463	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_008086	C	6	6	6500	6505	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
35	NC_008086	A	7	7	6506	6512	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_008086	A	8	8	6521	6528	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_008086	A	7	7	6535	6541	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_008086	AAG	2	6	6566	6571	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_008086	A	6	6	8530	8535	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_008086	GA	8	16	8569	8584	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_008086	T	7	7	8594	8600	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_008086	AAATT	2	10	8616	8625	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_008086	TAAG	2	8	8648	8655	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_008086	T	13	13	8687	8699	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_008086	T	6	6	8731	8736	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_008086	TTTG	2	8	8742	8749	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_008086	GGT	2	6	8750	8755	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_008086	TGT	2	6	8821	8826	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_008086	AAG	2	6	8869	8874	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_008086	A	6	6	8886	8891	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_008086	TAA	3	9	10565	10573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_008086	ATAA	2	8	10956	10963	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_008086	TTA	2	6	10986	10991	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_008086	ATA	3	9	11045	11053	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_008086	ATT	2	6	11065	11070	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_008086	TTA	2	6	11129	11134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_008086	T	6	6	11142	11147	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_008086	TATT	2	8	11155	11162	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_008086	ATTC	2	8	11170	11177	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_008086	ACA	2	6	11187	11192	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_008086	AAAG	2	8	11206	11213	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_008086	A	7	7	13997	14003	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_008086	AGG	2	6	14028	14033	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_008086	GCTTT	2	10	14885	14894	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
65	NC_008086	T	6	6	14892	14897	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_008086	T	7	7	14953	14959	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_008086	ATA	2	6	14963	14968	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_008086	TTAA	2	8	14982	14989	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_008086	CA	3	6	17970	17975	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_008086	CTG	2	6	17991	17996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_008086	A	7	7	18125	18131	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_008086	A	7	7	19565	19571	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_008086	AC	3	6	23994	23999	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_008086	ATCA	2	8	24008	24015	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_008086	T	6	6	24077	24082	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_008086	GGT	2	6	24085	24090	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_008086	TGT	2	6	24118	24123	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_008086	TCA	2	6	24130	24135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_008086	TAT	2	6	24230	24235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_008086	TTTCTT	2	12	24245	24256	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_008086	TGA	2	6	24275	24280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_008086	GCTT	2	8	24393	24400	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
83	NC_008086	A	6	6	24423	24428	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_008086	AATCA	2	10	24462	24471	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
85	NC_008086	A	6	6	24471	24476	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_008086	TTTG	2	8	24478	24485	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_008086	A	6	6	24490	24495	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_008086	A	6	6	24498	24503	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_008086	GAG	2	6	24546	24551	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_008086	A	6	6	24558	24563	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_008086	C	8	8	24570	24577	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
92	NC_008086	A	6	6	24578	24583	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_008086	G	6	6	24597	24602	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
94	NC_008086	CTT	2	6	26692	26697	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_008086	GATT	2	8	26705	26712	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_008086	TAAG	2	8	26743	26750	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_008086	A	19	19	26826	26844	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_008086	GTT	2	6	26906	26911	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_008086	A	7	7	26929	26935	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_008086	TGT	2	6	26964	26969	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_008086	AG	3	6	27005	27010	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_008086	T	6	6	27025	27030	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_008086	TTA	2	6	27097	27102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_008086	GCTT	2	8	27112	27119	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
105	NC_008086	ATC	2	6	27171	27176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_008086	AGCCT	2	10	27193	27202	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
107	NC_008086	A	6	6	28541	28546	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_008086	A	8	8	28620	28627	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_008086	TA	3	6	28641	28646	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_008086	T	6	6	29981	29986	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_008086	A	6	6	30008	30013	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_008086	GGTT	2	8	33035	33042	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_008086	TAA	2	6	41673	41678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_008086	A	6	6	41683	41688	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_008086	AG	3	6	41693	41698	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_008086	CAAA	2	8	45319	45326	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
117	NC_008086	T	6	6	45381	45386	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_008086	ATC	2	6	45387	45392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_008086	T	6	6	45407	45412	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_008086	TGT	2	6	45447	45452	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_008086	TAG	2	6	45477	45482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_008086	TTTAG	2	10	45484	45493	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
123	NC_008086	A	6	6	45503	45508	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_008086	AAC	2	6	49801	49806	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_008086	TC	3	6	52654	52659	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_008086	AAG	2	6	53527	53532	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_008086	TTGA	2	8	53538	53545	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_008086	GTT	2	6	53553	53558	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_008086	AAAT	2	8	53577	53584	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_008086	TTTA	2	8	58900	58907	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_008086	T	6	6	58971	58976	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_008086	TAAT	2	8	59000	59007	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_008086	AAAT	2	8	59109	59116	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_008086	TTAAA	2	10	59169	59178	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_008086	ACAA	2	8	59198	59205	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
136	NC_008086	G	7	7	59450	59456	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
137	NC_008086	ATA	2	6	59457	59462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_008086	AAC	2	6	59494	59499	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_008086	TC	3	6	59726	59731	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
140	NC_008086	CTTT	2	8	59744	59751	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
141	NC_008086	TCT	2	6	59764	59769	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_008086	A	7	7	59802	59808	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_008086	A	6	6	59821	59826	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_008086	AAG	2	6	59831	59836	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
145	NC_008086	AAG	2	6	59840	59845	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
146	NC_008086	G	9	9	69568	69576	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
147	NC_008086	A	7	7	69579	69585	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_008086	A	8	8	69593	69600	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_008086	A	8	8	69608	69615	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_008086	A	8	8	69623	69630	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_008086	A	8	8	69638	69645	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_008086	A	7	7	69653	69659	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_008086	G	8	8	69660	69667	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
154	NC_008086	CAAA	2	8	73026	73033	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
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